Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Carmil1Q6EDY6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Carmil1Q6EDY6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms