Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg9bQ6EBV9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg9bQ6EBV9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg9bQ6EBV9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg9bQ6EBV9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg9bQ6EBV9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg9bQ6EBV9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg9bQ6EBV9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg9bQ6EBV9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg9bQ6EBV9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg9bQ6EBV9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg9bQ6EBV9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg9bQ6EBV9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms