Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rftn1Q6A0D4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms