Protein–RNA interactions for Protein: Q6A009

Ltn1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, mousemouse

Predictions only

Length 1,767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltn1Q6A009 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ltn1Q6A009 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ltn1Q6A009 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms