Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sv2cQ69ZS6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sv2cQ69ZS6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sv2cQ69ZS6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sv2cQ69ZS6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sv2cQ69ZS6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sv2cQ69ZS6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sv2cQ69ZS6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sv2cQ69ZS6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sv2cQ69ZS6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sv2cQ69ZS6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sv2cQ69ZS6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sv2cQ69ZS6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sv2cQ69ZS6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sv2cQ69ZS6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sv2cQ69ZS6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Sv2cQ69ZS6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sv2cQ69ZS6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sv2cQ69ZS6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Sv2cQ69ZS6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sv2cQ69ZS6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sv2cQ69ZS6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms