Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZP3

Pnkd, Probable hydrolase PNKD, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkdQ69ZP3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PnkdQ69ZP3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PnkdQ69ZP3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PnkdQ69ZP3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PnkdQ69ZP3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PnkdQ69ZP3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PnkdQ69ZP3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PnkdQ69ZP3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PnkdQ69ZP3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PnkdQ69ZP3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PnkdQ69ZP3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PnkdQ69ZP3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PnkdQ69ZP3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PnkdQ69ZP3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PnkdQ69ZP3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PnkdQ69ZP3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PnkdQ69ZP3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PnkdQ69ZP3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PnkdQ69ZP3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PnkdQ69ZP3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PnkdQ69ZP3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PnkdQ69ZP3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PnkdQ69ZP3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PnkdQ69ZP3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PnkdQ69ZP3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms