Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fgd6Q69ZL1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Fgd6Q69ZL1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fgd6Q69ZL1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Fgd6Q69ZL1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Fgd6Q69ZL1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Fgd6Q69ZL1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fgd6Q69ZL1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fgd6Q69ZL1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fgd6Q69ZL1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fgd6Q69ZL1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fgd6Q69ZL1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fgd6Q69ZL1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fgd6Q69ZL1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Fgd6Q69ZL1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fgd6Q69ZL1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fgd6Q69ZL1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Fgd6Q69ZL1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fgd6Q69ZL1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Fgd6Q69ZL1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fgd6Q69ZL1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fgd6Q69ZL1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fgd6Q69ZL1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fgd6Q69ZL1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fgd6Q69ZL1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fgd6Q69ZL1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Fgd6Q69ZL1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fgd6Q69ZL1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fgd6Q69ZL1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fgd6Q69ZL1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fgd6Q69ZL1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fgd6Q69ZL1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fgd6Q69ZL1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fgd6Q69ZL1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fgd6Q69ZL1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Fgd6Q69ZL1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fgd6Q69ZL1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fgd6Q69ZL1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fgd6Q69ZL1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fgd6Q69ZL1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fgd6Q69ZL1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fgd6Q69ZL1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fgd6Q69ZL1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fgd6Q69ZL1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fgd6Q69ZL1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fgd6Q69ZL1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms