Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk13Q69ZA1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk13Q69ZA1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk13Q69ZA1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk13Q69ZA1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk13Q69ZA1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk13Q69ZA1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk13Q69ZA1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk13Q69ZA1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk13Q69ZA1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk13Q69ZA1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk13Q69ZA1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk13Q69ZA1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk13Q69ZA1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk13Q69ZA1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk13Q69ZA1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk13Q69ZA1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk13Q69ZA1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk13Q69ZA1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk13Q69ZA1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk13Q69ZA1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk13Q69ZA1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk13Q69ZA1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk13Q69ZA1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk13Q69ZA1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk13Q69ZA1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk13Q69ZA1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk13Q69ZA1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk13Q69ZA1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk13Q69ZA1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk13Q69ZA1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk13Q69ZA1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdk13Q69ZA1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdk13Q69ZA1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdk13Q69ZA1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdk13Q69ZA1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdk13Q69ZA1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdk13Q69ZA1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdk13Q69ZA1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdk13Q69ZA1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdk13Q69ZA1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdk13Q69ZA1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdk13Q69ZA1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdk13Q69ZA1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Cdk13Q69ZA1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Cdk13Q69ZA1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms