Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp4Q68FH0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp4Q68FH0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms