Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kiaa1549Q68FD9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kiaa1549Q68FD9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kiaa1549Q68FD9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kiaa1549Q68FD9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kiaa1549Q68FD9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kiaa1549Q68FD9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kiaa1549Q68FD9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kiaa1549Q68FD9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kiaa1549Q68FD9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kiaa1549Q68FD9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kiaa1549Q68FD9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kiaa1549Q68FD9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kiaa1549Q68FD9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kiaa1549Q68FD9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Kiaa1549Q68FD9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kiaa1549Q68FD9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kiaa1549Q68FD9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Kiaa1549Q68FD9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kiaa1549Q68FD9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms