Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nlrp4eQ66X19 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nlrp4eQ66X19 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nlrp4eQ66X19 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nlrp4eQ66X19 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nlrp4eQ66X19 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nlrp4eQ66X19 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nlrp4eQ66X19 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nlrp4eQ66X19 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nlrp4eQ66X19 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nlrp4eQ66X19 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp4eQ66X19 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp4eQ66X19 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp4eQ66X19 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp4eQ66X19 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp4eQ66X19 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp4eQ66X19 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp4eQ66X19 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp4eQ66X19 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp4eQ66X19 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp4eQ66X19 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp4eQ66X19 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp4eQ66X19 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp4eQ66X19 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp4eQ66X19 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp4eQ66X19 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp4eQ66X19 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrp4eQ66X19 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms