Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ino80dQ66JY2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ino80dQ66JY2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 629.6 ms