Protein–RNA interactions for Protein: Q64444

Ca4, Carbonic anhydrase 4, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca4Q64444 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ca4Q64444 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ca4Q64444 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ca4Q64444 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ca4Q64444 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ca4Q64444 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ca4Q64444 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ca4Q64444 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ca4Q64444 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ca4Q64444 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ca4Q64444 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ca4Q64444 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ca4Q64444 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ca4Q64444 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ca4Q64444 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ca4Q64444 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ca4Q64444 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ca4Q64444 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ca4Q64444 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ca4Q64444 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ca4Q64444 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ca4Q64444 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ca4Q64444 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ca4Q64444 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ca4Q64444 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ca4Q64444 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ca4Q64444 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ca4Q64444 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ca4Q64444 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ca4Q64444 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ca4Q64444 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ca4Q64444 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ca4Q64444 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ca4Q64444 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ca4Q64444 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ca4Q64444 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ca4Q64444 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ca4Q64444 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ca4Q64444 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ca4Q64444 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ca4Q64444 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ca4Q64444 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ca4Q64444 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ca4Q64444 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ca4Q64444 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ca4Q64444 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ca4Q64444 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms