Protein–RNA interactions for Protein: Q64318

Zeb1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb1Q64318 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Zeb1Q64318 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Zeb1Q64318 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Zeb1Q64318 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Zeb1Q64318 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Zeb1Q64318 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Zeb1Q64318 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Zeb1Q64318 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Zeb1Q64318 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Zeb1Q64318 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Zeb1Q64318 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Zeb1Q64318 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Zeb1Q64318 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Zeb1Q64318 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Zeb1Q64318 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Zeb1Q64318 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Zeb1Q64318 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Zeb1Q64318 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Zeb1Q64318 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Zeb1Q64318 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Zeb1Q64318 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Zeb1Q64318 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Zeb1Q64318 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Zeb1Q64318 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Zeb1Q64318 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Zeb1Q64318 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Zeb1Q64318 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Zeb1Q64318 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Zeb1Q64318 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Zeb1Q64318 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms