Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Surf4Q64310 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Surf4Q64310 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms