Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sf1Q64213 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf1Q64213 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms