Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pan3Q640Q5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms