Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Col4a5Q63ZW6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms