Protein–RNA interactions for Protein: Q62521

Zic3, Zinc finger protein ZIC 3, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic3Q62521 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms