Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zic2Q62520 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Zic2Q62520 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zic2Q62520 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zic2Q62520 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zic2Q62520 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms