Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxa13Q62424 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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