Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TrhQ62361 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrhQ62361 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TrhQ62361 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TrhQ62361 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms