Protein–RNA interactions for Protein: Q62288

Spock1, Testican-1, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock1Q62288 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Spock1Q62288 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spock1Q62288 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms