Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Ss18Q62280 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Ss18Q62280 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Ss18Q62280 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ss18Q62280 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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