Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SypQ62277 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SypQ62277 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SypQ62277 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SypQ62277 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SypQ62277 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SypQ62277 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SypQ62277 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SypQ62277 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SypQ62277 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SypQ62277 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SypQ62277 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SypQ62277 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SypQ62277 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SypQ62277 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SypQ62277 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SypQ62277 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SypQ62277 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SypQ62277 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SypQ62277 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SypQ62277 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SypQ62277 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SypQ62277 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SypQ62277 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SypQ62277 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SypQ62277 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SypQ62277 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SypQ62277 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SypQ62277 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SypQ62277 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SypQ62277 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SypQ62277 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SypQ62277 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SypQ62277 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SypQ62277 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SypQ62277 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SypQ62277 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SypQ62277 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SypQ62277 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SypQ62277 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SypQ62277 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SypQ62277 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SypQ62277 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SypQ62277 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SypQ62277 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SypQ62277 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SypQ62277 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SypQ62277 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SypQ62277 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SypQ62277 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SypQ62277 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SypQ62277 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SypQ62277 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SypQ62277 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SypQ62277 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SypQ62277 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SypQ62277 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SypQ62277 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SypQ62277 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SypQ62277 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SypQ62277 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SypQ62277 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SypQ62277 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SypQ62277 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SypQ62277 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SypQ62277 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SypQ62277 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SypQ62277 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SypQ62277 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SypQ62277 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SypQ62277 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SypQ62277 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SypQ62277 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SypQ62277 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SypQ62277 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SypQ62277 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SypQ62277 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SypQ62277 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SypQ62277 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SypQ62277 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SypQ62277 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SypQ62277 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SypQ62277 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SypQ62277 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SypQ62277 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SypQ62277 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SypQ62277 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SypQ62277 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SypQ62277 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SypQ62277 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SypQ62277 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SypQ62277 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SypQ62277 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SypQ62277 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SypQ62277 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SypQ62277 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SypQ62277 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SypQ62277 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SypQ62277 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SypQ62277 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms