Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Kdm5dQ62240 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Kdm5dQ62240 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Kdm5dQ62240 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Kdm5dQ62240 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Kdm5dQ62240 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Kdm5dQ62240 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Kdm5dQ62240 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Kdm5dQ62240 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Kdm5dQ62240 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Kdm5dQ62240 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Kdm5dQ62240 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Kdm5dQ62240 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Kdm5dQ62240 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Kdm5dQ62240 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Kdm5dQ62240 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Kdm5dQ62240 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Kdm5dQ62240 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Kdm5dQ62240 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Kdm5dQ62240 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Kdm5dQ62240 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Kdm5dQ62240 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Kdm5dQ62240 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Kdm5dQ62240 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Kdm5dQ62240 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Kdm5dQ62240 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Kdm5dQ62240 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Kdm5dQ62240 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Kdm5dQ62240 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Kdm5dQ62240 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Kdm5dQ62240 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Kdm5dQ62240 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Kdm5dQ62240 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Kdm5dQ62240 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Kdm5dQ62240 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Kdm5dQ62240 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms