Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SnrpaQ62189 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpaQ62189 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms