Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms