Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 AC115784.1-201ENSMUST00000227687 1010 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Ctcflos-203ENSMUST00000144256 1237 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Prm3Q62100 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prm3Q62100 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms