Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Odf1Q61999 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf1Q61999 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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