Protein–RNA interactions for Protein: Q61830

Mrc1, Macrophage mannose receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrc1Q61830 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mrc1Q61830 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms