Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrn1Q61809 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrn1Q61809 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrn1Q61809 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrn1Q61809 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrn1Q61809 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrn1Q61809 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrn1Q61809 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrn1Q61809 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrn1Q61809 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrn1Q61809 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrn1Q61809 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrn1Q61809 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrn1Q61809 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrn1Q61809 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrn1Q61809 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrn1Q61809 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrn1Q61809 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrn1Q61809 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrn1Q61809 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrn1Q61809 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrn1Q61809 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrn1Q61809 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrn1Q61809 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrn1Q61809 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrn1Q61809 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrn1Q61809 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrn1Q61809 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrn1Q61809 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrn1Q61809 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrn1Q61809 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrn1Q61809 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrn1Q61809 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrn1Q61809 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrn1Q61809 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrn1Q61809 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Lrrn1Q61809 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Lrrn1Q61809 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrn1Q61809 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrn1Q61809 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Lrrn1Q61809 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrn1Q61809 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrn1Q61809 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrn1Q61809 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
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Lrrn1Q61809 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrn1Q61809 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrn1Q61809 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrn1Q61809 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrn1Q61809 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrn1Q61809 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrn1Q61809 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrn1Q61809 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrn1Q61809 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Lrrn1Q61809 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrn1Q61809 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrn1Q61809 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Lrrn1Q61809 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Lrrn1Q61809 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrn1Q61809 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrn1Q61809 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrn1Q61809 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Lrrn1Q61809 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrn1Q61809 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrn1Q61809 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrn1Q61809 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrn1Q61809 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrn1Q61809 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrn1Q61809 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrn1Q61809 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrn1Q61809 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrn1Q61809 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrn1Q61809 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrn1Q61809 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrn1Q61809 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrn1Q61809 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrn1Q61809 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrn1Q61809 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrn1Q61809 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrn1Q61809 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrn1Q61809 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrn1Q61809 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrn1Q61809 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrn1Q61809 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms