Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gli3Q61602 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gli3Q61602 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms