Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccne1Q61457 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccne1Q61457 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms