Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcolceQ61398 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcolceQ61398 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcolceQ61398 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcolceQ61398 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcolceQ61398 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcolceQ61398 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcolceQ61398 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcolceQ61398 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcolceQ61398 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcolceQ61398 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcolceQ61398 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcolceQ61398 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcolceQ61398 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcolceQ61398 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcolceQ61398 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcolceQ61398 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcolceQ61398 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcolceQ61398 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcolceQ61398 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcolceQ61398 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcolceQ61398 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcolceQ61398 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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PcolceQ61398 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcolceQ61398 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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PcolceQ61398 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcolceQ61398 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcolceQ61398 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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PcolceQ61398 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PcolceQ61398 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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PcolceQ61398 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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PcolceQ61398 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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PcolceQ61398 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcolceQ61398 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcolceQ61398 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcolceQ61398 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcolceQ61398 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PcolceQ61398 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PcolceQ61398 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PcolceQ61398 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PcolceQ61398 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PcolceQ61398 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PcolceQ61398 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PcolceQ61398 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PcolceQ61398 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PcolceQ61398 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PcolceQ61398 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PcolceQ61398 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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