Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tfap2bQ61313 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tfap2bQ61313 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tfap2bQ61313 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tfap2bQ61313 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tfap2bQ61313 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tfap2bQ61313 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tfap2bQ61313 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tfap2bQ61313 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tfap2bQ61313 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tfap2bQ61313 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tfap2bQ61313 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tfap2bQ61313 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tfap2bQ61313 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tfap2bQ61313 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tfap2bQ61313 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tfap2bQ61313 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tfap2bQ61313 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tfap2bQ61313 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Tfap2bQ61313 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tfap2bQ61313 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tfap2bQ61313 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tfap2bQ61313 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tfap2bQ61313 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tfap2bQ61313 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tfap2bQ61313 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tfap2bQ61313 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tfap2bQ61313 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms