Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcd2Q61285 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcd2Q61285 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcd2Q61285 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcd2Q61285 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcd2Q61285 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd2Q61285 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd2Q61285 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd2Q61285 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd2Q61285 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd2Q61285 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd2Q61285 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd2Q61285 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd2Q61285 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd2Q61285 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd2Q61285 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd2Q61285 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd2Q61285 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd2Q61285 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd2Q61285 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd2Q61285 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd2Q61285 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd2Q61285 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcd2Q61285 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcd2Q61285 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcd2Q61285 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcd2Q61285 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcd2Q61285 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcd2Q61285 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcd2Q61285 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcd2Q61285 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcd2Q61285 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcd2Q61285 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcd2Q61285 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcd2Q61285 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcd2Q61285 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcd2Q61285 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcd2Q61285 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms