Protein–RNA interactions for Protein: Q61271

Acvr1b, Activin receptor type-1B, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1bQ61271 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acvr1bQ61271 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms