Protein–RNA interactions for Protein: Q61194

Pik3c2a, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c2aQ61194 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pik3c2aQ61194 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pik3c2aQ61194 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pik3c2aQ61194 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pik3c2aQ61194 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pik3c2aQ61194 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pik3c2aQ61194 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pik3c2aQ61194 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pik3c2aQ61194 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pik3c2aQ61194 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pik3c2aQ61194 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pik3c2aQ61194 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pik3c2aQ61194 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pik3c2aQ61194 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pik3c2aQ61194 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pik3c2aQ61194 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pik3c2aQ61194 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pik3c2aQ61194 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pik3c2aQ61194 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pik3c2aQ61194 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pik3c2aQ61194 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pik3c2aQ61194 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pik3c2aQ61194 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pik3c2aQ61194 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pik3c2aQ61194 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pik3c2aQ61194 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pik3c2aQ61194 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pik3c2aQ61194 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pik3c2aQ61194 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pik3c2aQ61194 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pik3c2aQ61194 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pik3c2aQ61194 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms