Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
JrkQ60976 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JrkQ60976 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
JrkQ60976 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JrkQ60976 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
JrkQ60976 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
JrkQ60976 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
JrkQ60976 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
JrkQ60976 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
JrkQ60976 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
JrkQ60976 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
JrkQ60976 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
JrkQ60976 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
JrkQ60976 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
JrkQ60976 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
JrkQ60976 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
JrkQ60976 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
JrkQ60976 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
JrkQ60976 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
JrkQ60976 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
JrkQ60976 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
JrkQ60976 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms