Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbbp4Q60972 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp4Q60972 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms