Protein–RNA interactions for Protein: Q60696

Pmel, Melanocyte protein PMEL, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmelQ60696 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PmelQ60696 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PmelQ60696 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PmelQ60696 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PmelQ60696 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PmelQ60696 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PmelQ60696 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PmelQ60696 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PmelQ60696 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PmelQ60696 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PmelQ60696 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms