Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CttnQ60598 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CttnQ60598 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CttnQ60598 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CttnQ60598 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CttnQ60598 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CttnQ60598 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CttnQ60598 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CttnQ60598 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CttnQ60598 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CttnQ60598 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CttnQ60598 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CttnQ60598 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CttnQ60598 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CttnQ60598 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CttnQ60598 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CttnQ60598 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CttnQ60598 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CttnQ60598 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CttnQ60598 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CttnQ60598 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CttnQ60598 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CttnQ60598 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CttnQ60598 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CttnQ60598 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CttnQ60598 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CttnQ60598 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CttnQ60598 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CttnQ60598 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.6 ms