Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJV6

Lmtk3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmtk3Q5XJV6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmtk3Q5XJV6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lmtk3Q5XJV6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmtk3Q5XJV6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmtk3Q5XJV6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmtk3Q5XJV6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmtk3Q5XJV6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmtk3Q5XJV6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmtk3Q5XJV6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmtk3Q5XJV6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmtk3Q5XJV6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmtk3Q5XJV6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmtk3Q5XJV6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmtk3Q5XJV6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmtk3Q5XJV6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmtk3Q5XJV6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmtk3Q5XJV6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmtk3Q5XJV6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmtk3Q5XJV6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmtk3Q5XJV6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmtk3Q5XJV6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmtk3Q5XJV6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmtk3Q5XJV6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmtk3Q5XJV6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmtk3Q5XJV6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmtk3Q5XJV6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmtk3Q5XJV6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmtk3Q5XJV6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmtk3Q5XJV6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmtk3Q5XJV6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmtk3Q5XJV6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmtk3Q5XJV6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmtk3Q5XJV6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmtk3Q5XJV6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmtk3Q5XJV6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmtk3Q5XJV6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmtk3Q5XJV6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmtk3Q5XJV6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lmtk3Q5XJV6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lmtk3Q5XJV6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lmtk3Q5XJV6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lmtk3Q5XJV6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lmtk3Q5XJV6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms