Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp13a3Q5XF89 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp13a3Q5XF89 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp13a3Q5XF89 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp13a3Q5XF89 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp13a3Q5XF89 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp13a3Q5XF89 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp13a3Q5XF89 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp13a3Q5XF89 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp13a3Q5XF89 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp13a3Q5XF89 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp13a3Q5XF89 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp13a3Q5XF89 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp13a3Q5XF89 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp13a3Q5XF89 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp13a3Q5XF89 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp13a3Q5XF89 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp13a3Q5XF89 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp13a3Q5XF89 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp13a3Q5XF89 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp13a3Q5XF89 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp13a3Q5XF89 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp13a3Q5XF89 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp13a3Q5XF89 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp13a3Q5XF89 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp13a3Q5XF89 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp13a3Q5XF89 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp13a3Q5XF89 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp13a3Q5XF89 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp13a3Q5XF89 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp13a3Q5XF89 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp13a3Q5XF89 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp13a3Q5XF89 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp13a3Q5XF89 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Atp13a3Q5XF89 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms