Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdcp1Q5U462 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdcp1Q5U462 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms