Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX39

Myh4, Myosin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh4Q5SX39 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Myh4Q5SX39 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Myh4Q5SX39 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Myh4Q5SX39 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Myh4Q5SX39 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Myh4Q5SX39 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Myh4Q5SX39 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Myh4Q5SX39 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Myh4Q5SX39 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Myh4Q5SX39 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Myh4Q5SX39 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Myh4Q5SX39 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Myh4Q5SX39 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Myh4Q5SX39 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Myh4Q5SX39 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Myh4Q5SX39 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Myh4Q5SX39 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Myh4Q5SX39 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Myh4Q5SX39 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Myh4Q5SX39 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Myh4Q5SX39 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Myh4Q5SX39 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Myh4Q5SX39 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Myh4Q5SX39 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Myh4Q5SX39 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Myh4Q5SX39 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Myh4Q5SX39 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Myh4Q5SX39 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Myh4Q5SX39 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Myh4Q5SX39 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Myh4Q5SX39 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Myh4Q5SX39 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Myh4Q5SX39 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms