Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms