Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Psme4Q5SSW2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psme4Q5SSW2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms