Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQY2

Bod1, Biorientation of chromosomes in cell division protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bod1Q5SQY2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bod1Q5SQY2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bod1Q5SQY2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms